Согласно ст. 34 СК РФ имущество, нажитое супрагуми во время брака, является общим независимо от того, на кого из супругов оформлены права. Таким образом, кооперативная квартира принадлежит и Вашей маме, даже если справка о выплате пая выдана только на отца. В случае развода у Вашей мамы будет право на 1/2 квартиры, при условии раздела имущества в течение трех лет после развода. Иначе квартира останется в единоличной собственности Вашего отца. Для совершения сделок по распоряжению недвижимым имуществом требуется письменное (на практике - нотариально удостоверенное) согласие другого супруга. Поэтому в период брака распорядиться квартирой сам Ваш отец не может.